O negócio evolui de forma a ajustar-se ou servir de motor a alterações económicas, sociais e tecnológicas, as quais podem ocorrer interna ou externamente à organização. Essa evolução traduz-se frequentemente na redefinição de metas e estratégias bem como em alterações na organização do trabalho e na infra-estrutura tecnológica e aplicacional, com a finalidade de alinhar as competências organizacionais com as necessidades e exigências do mercado em que opera. A evolução das tecnologias vem, por sua vez, colocar desafios e criar oportunidades ao negócio. As novas tecnologias proporcionam muitas vezes uma maior eficiência e eficácia dos processos organizacionais, o que representa uma oportunidade para reduzir custos ou satisfazer melhor a procura tornando a organização mais competitiva. Por outro lado, a emergência de "pacotes" informáticos de aceitação alargada em determinados segmentos de mercado e áreas de negócio criam uma obrigatoriedade da sua adopção e exploração por parte das organizações que pretendam manter-se competitivas e em consonância com práticas de negócio alinhadas com as normas de qualidade vigentes. O mercado global traz consigo novas necessidades de interacção entre organizações bem como mudança das configurações das organizacionais o que, consequentemente, resulta em complexos desafios de integração e interoperabilidade de plataformas informáticas.

Numa realidade cada vez mais global, os valores e pressupostos que orientam a prática profissional tendem a estar cada vez mais difundidos e uniformizados nas várias culturas. Assim, as Tecnologias da Informação surgem como instrumento de uniformização das práticas profissionais nas grandes áreas de intervenção humana. Por outro lado, a ética profissional que deve regular a actuação dos profissionais dos meios de comunicação bem como os valores que devem orientar (ou não) a expansão da informação e serviços disponibilizados na Internet são questões que preocupam cada vez mais o cidadão, continuamente bombardeado por informação e com cada vez menos possibilidade de avaliar a utilidade e veracidade dessa mesma informação.

A globalização e consequente disseminação de informação e serviços web vêm colocar ainda a questão da segurança das transacções e da privacidade da informação que as organizações e o Estado possuem acerca dos indivíduos e grupos sociais.

De tudo isto resulta uma enorme diversidade de questões relevantes para o aluno do Mestrado em Sistemas de Informação, possibilitando um conjunto diversificado de especializações por que o aluno poderá optar consoante as suas necessidades de formação e formação de base. Para o Mestrado fica o desafio de desenvolver competências diversas e complementares à formação de base dos estudantes que podem ingressar no curso, nomeadamente, estudantes com um 1º ciclo de formação em Tecnologias e Sistemas de Informação, Informática, Ciências da Computação, Ciências dos Computadores, Economia, Gestão, Ciências da Organização, e Ciências Sociais e Humanas. Apesar desta diversidade de formação de base e de experiências poder acarretar desafios ao processo de ensino-aprendizagem, a verdade é que gera a possibilidade de abordar de forma mais ampla e mais rica os vários aspectos organizacionais, sociais e tecnológicos relacionados com a gestão, o desenvolvimento e a utilização das Tecnologias e Sistemas de Informação nas organizações e na sociedade. Assume-se, deste modo, o propósito de aproveitar diferentes formações e experiências no desenvolvimento de profissionais multifacetados, inovadores e altamente capacitados para responderem aos desafios impostos por uma realidade complexa e em constante mutação.